高山族還保留有原始宗教的信仰和儀式。他們崇拜精靈，各地信仰的神不一，有天神、創造宇宙之神、自然神、司理神和其他精靈妖怪。祭儀有農事祭（包括開墾祭、播種祭、除草祭、收刈祭、新谷入倉會等，主要的是栗祭）、狩獵祭、漁祭、祖靈祭等。盛行巫術，其占卜方法有鳥卜、夢卜、水占、竹占、瓢占、飯占等，并有多種形式的巫術。��

　　高山族社會是一個靈魂崇拜及祭祀盛行的社會。

　　靈魂，被認為充斥于宇宙萬物，從浩渺蒼穹的日月星辰、浮云彩霞、霹靂閃電，到遼闊大地的山川湖海、飛禽走獸、螣蛇游魚，無不具有神秘的靈魂。在他們看來，千年古木的蓊郁蔥蘢，蕭瑟茅蘆的迎風搖曳，如同活人動作神態一樣，是受某種靈魂所支配的。這種泛神論觀念存在于撲朔迷離的圖騰神話和圖騰藝術里面，也體現于繁褥冗長的祭祀儀禮之中，例如人祖神話傳說中溯源人類生于巨石、大樹、蛇、蟲、鳥等，排灣人在門楣窗檐以及人體上有關百步蛇與人頭的的紋飾與圖繪，曹人對榕樹的祭禮與禁忌，都是泛神論觀念的產物。

　　高山族一般相信人死后靈魂不滅永世長存，并在默默中保佑其子孫后代。一般稱靈魂為神，對神的信仰大部分就是對祖先的崇拜。從而將祖訓看成是神的旨意不敢違犯。同時還相信祖神會附托在動物身上。傳說“西稀利”（小鳥，形似麻雀）和“夫倫”（毒蛇名，即百步蛇）是神靈的化身，人們不能殺害。過去，高山族中還傳說“西稀利”的不同叫聲，會暗示給人吉兇禍福，排灣人之后以喜愛蛇形的雕刻，據說也是為了祈求祖先保佑。對其他的自然現象、疾疫、災害等，都認為有神在司掌。神有好壞之分，祭祀好神求降人以幸福，農業豐收，多得獵物和魚類，并祈禱好神消除壞神所帶來的各種災害�？傊�，祖靈崇拜不僅滲透到高山族社會生活的各個方面，而且了深入到每個人的意識形態領域，變成人們精神生活的一種強有力的支柱。